기획예산처는 기금정책심의회 심의(3.23)와 국무회의의 의결(3.29)을 거쳐 기금 자산운용체계 확립, 기금평가제도의 내실화, 기금의 국민경제적 역할 강화 등에 중점을 둔 ｢2006년도 기금 운용계획안 작성지침｣을 확정하였다. 작성지침의 주요 내용을 보면, 일자리 창출 등 경기활성화 효과가 큰 사업에 집중 투자하고 기존사업의 구조조정을 통해 마련한 재원으로 국책과제 등 새로운 사업소요를 지원하여 기금의 국민경제적 역할과 기능을 강화키로 하였다. 기금분야별로는 성장잠재력 확충, 취약계층에 대한 지원 및 삶의 질 향상을 위한 여건조성 등에 중점 지원하여 국정과제 수행을 차질 없이 뒷받침하며, 특히 성장잠재력을 확충하기 위해 IT.BT 등 차세대 성장동력 관련사업과 중소기업의 기술개발 및 신재생 에너지 관련분야를 적극 지원할 계획이라고 하였다.
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