12월 21일 개최된 2005년도 제5차 보건의료기술정책심의위원회에서는 "2005년도 하반기 보건의료기술진흥사업 연차.중간.최종평가 및 신규과제 선정결과(안)"과 "2006년도 보건의료기술진흥사업 시행계획(안)" 및 "보건의료기술정책심의위원회 운영세칙(안)"이 의결되었다. '06년도 보건의료기술진흥사업 예산은 총 123,197백만원으로, '05년 대비 19,900백만원 증액(19.3% 증가), '06년도 한방치료기술연구개발사업 예산은 전년대비 7.6% 증가한 7,000백만원(기획평가운영비 210백만원 포함) 규모가 될 것으로 전망되었다. 또한, 보건의료기술진흥사업의 효율적 추진을 위해 사업목적이 유사한 사업을 통합, 기존의 7개 사업을 3개의 사업으로 개편하고, 평가.관리체계 개선을 통한 연구관리 내실화를 도모하기로 했다. 2005년도 하반기 보건의료기술진흥사업 계속지원 대상 33개 과제에 대한 평가결과 60점 이상인 33개 과제를 계속지원하고, 보건의료정보 EHR(전자건강기록) 핵심공통기술 사업단으로 개편되는 3과제에 대한 최종보고서 평가결과 보통으로 판정하였다. 또한, 2005년도 보건의료정보 EHR(전자건강기록) 핵심공통기술 사업단 신규과제 선정평가결과 지원과제로 선정하고, 평가결과에 따라 조정된 연구비 잔액(1,319백만원)에 대해서는 질병유전단백체연구지원센터 연구기자재 지원비(919백만원), 정책연구비(400백만원)에 추가 지원하기로 하였다. 내실 있는 보건의료기술정책심의위원회가 되도록 분야별 전문위원회를 구성하는 등 위원회 운영세칙을 의결했다. 진흥원내 보건의료기술평가위원회의 역할을 보건의료기술정책심의위원회와 분야별 전문위원회로 전환하고, 연 6회 이상 대면회의를 정례화하기로 하며, 위원회에서 위임한 사항 등에 대한 전문적인 연구.검토를 위하여 7개 분야별로 전문위원회 구성.운영하기로 하였다.
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